Het Scientific Programme Indonesia - Netherlands (SPIN) stimuleert langdurige wetenschappelijke samenwerking tussen onderzoekers en onderzoeksconsortia uit Indonesië en Nederland. Het programma doet dit door financiering van bilaterale onderzoeksprogramma's en ondersteunende activiteiten waar beide partijen belang bij hebben.

Het Ter Meulen Fonds bevordert medisch, biochemisch en biologisch onderzoek dat een bijdrage levert aan de kindergeneeskunde. Het fonds stelt stipendia en subsidies voor werkbezoeken beschikbaar voor personen die vanuit een Nederlandse universiteit of instelling wetenschappelijk onderzoek willen uitvoeren in het buitenland. Het doel is het verwerven van kennis die in Nederland toegepast kan worden.

Het Van ’t Hoff Fonds bevordert onderzoek in de scheikunde.

De Van der Gaag Stichting bevordert hoogwaardig, maatschappelijk relevant wetenschappelijk onderzoek naar biologische, psychologische en sociale determinanten van menselijk gedrag. De bedoeling is dat het onderzoek intermenselijke relaties en kennis van menselijk gedrag verbetert.

Het Van Leersumfonds verleent steun aan neuro(bio)logisch, radiologisch en farmaceutisch onderzoek.

Het Van Walree Fonds bevordert medisch onderzoek. Het fonds doet dit door subsidiering van buitenlandse congresbezoeken van medisch studenten.

Met het Visiting Professors Programme kunnen excellente wetenschappers uit het buitenland enige tijd in Nederland werken. Het programma is bedoeld om de Nederlandse wetenschap te versterken.

De KNAW heeft in 2012 eenmalig subsidies verstrekt aan (consortia van) universiteiten voor de financiering van meerjarige programma's van de Wetenschapsknooppunten. Het programma wordt meegefinancierd door het Platform Bèta Techniek.